公开资料库
科研开源能力图谱
把开源仓库和 Skill 拆成可以判断、比较和使用的科研能力。
- 已收录
- 52
- Stars 核对
- 2026-07-11
- GitHub 是什么？
- 一个公开存放和协作开发软件的网站，可以理解为开源工具的原始资料库。
- 为什么看这里的工具？
- 你能看到谁在维护、最近是否更新，并拿到真实安装地址。很多工具可以直接交给 AI 帮你安装和试用。
- Stars 怎么看？
- Star 是 GitHub 用户给项目点的公开收藏。数字高通常说明关注者较多，可帮助你先筛候选，但不等于质量评分。
本图谱收录与科研直接相关、GitHub Stars 超过 1,000，且原仓库可以追溯的项目；每项再补充用途、使用方式和注意事项。
| 名称 | 解决什么 | 科研阶段 | GitHub Stars | 站内反馈 | 进入 |
|---|---|---|---|---|---|
| Academic Research Skills Skill · Imbad0202/academic-research-skills | 解决什么在Claude Code中将研究、写作、审稿和修订串成可追溯的学术论文全流程 | 科研阶段 起步文献设计验证写作 | GitHub Stars 37,312 2026-07-11 | 站内反馈00 | |
| Scientific-Agent-Skills Skill · K-Dense-AI/scientific-agent-skills | 解决什么为AI科研代理提供文献检索、写作、统计、实验设计和同行评审的结构化能力。 | 科研阶段 文献设计分析写作 | GitHub Stars 30,670 2026-07-11 | 站内反馈00 | |
| Nature Skills Skill · Yuan1z0825/nature-skills | 解决什么覆盖论文精读、写作、润色、审稿回应与数据治理全流程的科研 Skill 集合 | 科研阶段 文献写作验证 | GitHub Stars 27,794 2026-07-11 | 站内反馈00 | |
| MLflow 开源仓库 · mlflow/mlflow | 解决什么AI工程平台，统一管理ML实验、LLM追踪、模型注册和部署 | 科研阶段 分析验证设计 | GitHub Stars 26,974 2026-07-11 | 站内反馈00 | |
| ChatPaper 开源仓库 · kaixindelele/ChatPaper | 解决什么用LLM进行论文搜索、阅读、翻译、审稿和综述草稿生成 | 科研阶段 文献写作 | GitHub Stars 19,664 2026-07-11 | 站内反馈00 | |
| DeepCode 开源仓库 · HKUDS/DeepCode | 解决什么从论文或需求文本自动生成可复现代码的智能编程工具 | 科研阶段 分析验证 | GitHub Stars 16,025 2026-07-11 | 站内反馈00 | |
| DVC 开源仓库 · iterative/dvc | 解决什么数据与模型版本管理工具，为机器学习项目提供可复现流水线 | 科研阶段 分析验证 | GitHub Stars 15,739 2026-07-11 | 站内反馈00 | |
| Unstructured 开源仓库 · Unstructured-IO/unstructured | 解决什么把PDF/HTML/Word/图片等非结构化文档转成LLM可消费的结构化元素列表 | 科研阶段 文献分析写作 | GitHub Stars 15,106 2026-07-11 | 站内反馈00 | |
| AI Scientist 开源仓库 · SakanaAI/AI-Scientist | 解决什么从研究想法自动生成、实验验证到论文发表的端到端科研流水线 | 科研阶段 起步文献分析验证写作 | GitHub Stars 14,197 2026-07-11 | 站内反馈00 | |
| ARIS (Auto-Claude-Code-Research-in-Sleep) 开源仓库 · wanshuiyin/Auto-claude-code-research-in-sleep | 解决什么用Markdown skill编排从选题到论文写作的科研全流程自动化 | 科研阶段 起步设计分析验证写作 | GitHub Stars 13,266 2026-07-11 | 站内反馈00 | |
| statsmodels 开源仓库 · statsmodels/statsmodels | 解决什么用经典统计推断方法做回归、时间序列、面板分析和假设检验。 | 科研阶段 分析验证 | GitHub Stars 11,503 2026-07-11 | 站内反馈00 | |
| AI Research SKILLs Skill · Orchestra-Research/AI-Research-SKILLs | 解决什么面向AI研究Agent的大型技能库，覆盖从构思到论文的科研全流程 | 科研阶段 起步文献设计分析验证写作 | GitHub Stars 10,603 2026-07-11 | 站内反馈00 | |
| PyMC 开源仓库 · pymc-devs/pymc | 解决什么用代码声明贝叶斯概率模型，通过MCMC或变分推断估计参数后验分布。 | 科研阶段 分析验证 | GitHub Stars 9,674 2026-07-11 | 站内反馈00 | |
| paper-qa 开源仓库 · Future-House/paper-qa | 解决什么从本地论文和文档中检索证据并生成带精确引用的科研答案 | 科研阶段 文献验证 | GitHub Stars 8,849 2026-07-11 | 站内反馈00 | |
| DoWhy 开源仓库 · py-why/dowhy | 解决什么端到端因果推断库，用四步流水线统一因果建模、识别、估计与反驳 | 科研阶段 设计分析验证 | GitHub Stars 8,208 2026-07-11 | 站内反馈00 | |
| Zotero GPT 开源仓库 · MuiseDestiny/zotero-gpt | 解决什么在Zotero内用GPT对论文全文进行问答、翻译、润色，并把结果写回笔记 | 科研阶段 文献写作 | GitHub Stars 7,251 2026-07-11 | 站内反馈00 | |
| arXiv LaTeX Cleaner 开源仓库 · google-research/arxiv-latex-cleaner | 解决什么一键清理LaTeX工程并优化体积，准备arXiv提交包 | 科研阶段 写作 | GitHub Stars 6,939 2026-07-11 | 站内反馈00 | |
| AI Scientist v2 开源仓库 · SakanaAI/AI-Scientist-v2 | 解决什么从开放研究主题到论文产出的端到端自动化科研流水线 | 科研阶段 起步文献设计分析验证写作 | GitHub Stars 6,800 2026-07-11 | 站内反馈00 | |
| Papermill 开源仓库 · nteract/papermill | 解决什么让 Jupyter Notebook 变成可用不同参数批量执行的参数化计算单元 | 科研阶段 分析验证 | GitHub Stars 6,460 2026-07-11 | 站内反馈00 | |
| causalml 开源仓库 · uber/causalml | 解决什么用机器学习估计个体处理效应并做uplift建模与策略优化 | 科研阶段 分析验证 | GitHub Stars 5,920 2026-07-11 | 站内反馈00 | |
| Agent Laboratory 开源仓库 · SamuelSchmidgall/AgentLaboratory | 解决什么用多Agent自动完成文献检索、实验代码生成和论文写作的研究流水线 | 科研阶段 起步文献设计分析验证写作 | GitHub Stars 5,741 2026-07-11 | 站内反馈00 | |
| Zotero arXiv Daily 开源仓库 · TideDra/zotero-arxiv-daily | 解决什么根据你的Zotero文献库兴趣画像，每日自动推荐arXiv/bioRxiv/medRxiv新论文到邮箱 | 科研阶段 起步文献 | GitHub Stars 5,675 2026-07-11 | 站内反馈00 | |
| AI Researcher 开源仓库 · HKUDS/AI-Researcher | 解决什么把机器学习研究想法或参考论文自动转成可运行实验和LaTeX论文 | 科研阶段 文献设计分析验证写作 | GitHub Stars 5,576 2026-07-11 | 站内反馈00 | |
| Research-Paper-Writing-Skills Skill · Master-cai/Research-Paper-Writing-Skills | 解决什么按章节拆分论文写作任务，用结构化模板和claim-evidence对齐检查提升稿件质量。 | 科研阶段 写作 | GitHub Stars 4,998 2026-07-11 | 站内反馈00 | |
| grobid 开源仓库 · kermitt2/grobid | 解决什么把学术论文PDF解析成结构化TEI XML，提取元数据、全文结构和参考文献 | 科研阶段 文献分析写作 | GitHub Stars 4,985 2026-07-11 | 站内反馈00 | |
| Paper2Code 开源仓库 · going-doer/Paper2Code | 解决什么把机器学习论文自动转为复现计划、代码文件和评估报告 | 科研阶段 设计分析验证 | GitHub Stars 4,795 2026-07-11 | 站内反馈00 | |
| EconML 开源仓库 · py-why/EconML | 解决什么异质性处理效应估计库，用正交机器学习估计个体化因果效应 | 科研阶段 设计分析 | GitHub Stars 4,708 2026-07-11 | 站内反馈00 | |
| claude-scholar 开源仓库 · Galaxy-Dawn/claude-scholar | 解决什么半自动化科研助手，用证据契约机制贯穿选题、实验分析、写作到审稿响应 | 科研阶段 起步文献分析验证写作 | GitHub Stars 4,573 2026-07-11 | 站内反馈00 | |
| Sacred 开源仓库 · IDSIA/sacred | 解决什么自动记录每次计算实验的配置、种子、依赖和结果，让实验可追溯、可复现。 | 科研阶段 分析验证 | GitHub Stars 4,367 2026-07-11 | 站内反馈00 | |
| AutoFigure-Edit 开源仓库 · ResearAI/AutoFigure-Edit | 解决什么把论文方法文本或已有位图转成可编辑SVG插图并自动替换图标 | 科研阶段 写作 | GitHub Stars 3,949 2026-07-11 | 站内反馈00 | |
| Supervisor-Skills Skill · HKUSTDial/Supervisor-Skills | 解决什么把导师的经验方法拆成7个AI可调用的技能，覆盖从idea评估到投稿审查全流程。 | 科研阶段 起步设计写作验证 | GitHub Stars 3,840 2026-07-11 | 站内反馈00 | |
| pgmpy 开源仓库 · pgmpy/pgmpy | 解决什么用图结构编码变量间的概率依赖和因果假设，做条件推断、因果发现与合成数据生成。 | 科研阶段 设计分析验证 | GitHub Stars 3,295 2026-07-11 | 站内反馈00 | |
| DeepScientist 开源仓库 · ResearAI/DeepScientist | 解决什么本地优先的科研操作系统，用多Agent自动推进研究全流程 | 科研阶段 起步文献设计分析验证写作 | GitHub Stars 3,179 2026-07-11 | 站内反馈00 | |
| arxiv-mcp-server 开源仓库 · blazickjp/arxiv-mcp-server | 解决什么让AI助手通过MCP协议搜索、下载和阅读arXiv论文 | 科研阶段 文献 | GitHub Stars 2,950 2026-07-11 | 站内反馈00 | |
| OpenClaw Medical Skills Skill · FreedomIntelligence/OpenClaw-Medical-Skills | 解决什么869 个面向临床研究、生物信息学和药物发现的医疗与生物医学 Skill 集合 | 科研阶段 文献设计验证 | GitHub Stars 2,826 2026-07-11 | 站内反馈00 | |
| Auto-Empirical-Research-Skills Skill · brycewang-stanford/Auto-Empirical-Research-Skills | 解决什么面向实证研究的agent skill发行仓，含完整pipeline、质量门和许可审计 | 科研阶段 设计分析验证写作 | GitHub Stars 2,790 2026-07-11 | 站内反馈00 | |
| PapersGPT for Zotero 开源仓库 · papersgpt/papersgpt-for-zotero | 解决什么在 Zotero 内直接用 LLM 对论文 PDF 提问并点击答案回到原文位置 | 科研阶段 文献 | GitHub Stars 2,504 2026-07-11 | 站内反馈00 | |
| Science-Skills Skill · google-deepmind/science-skills | 解决什么为AI科研助手提供37个可调用的生物信息学数据库查询和分子分析能力。 | 科研阶段 文献设计分析 | GitHub Stars 2,330 2026-07-11 | 站内反馈00 | |
| llm-for-zotero 开源仓库 · yilewang/llm-for-zotero | 解决什么Zotero插件，让LLM在论文库中阅读、检索、对比和写笔记 | 科研阶段 文献写作起步 | GitHub Stars 2,227 2026-07-11 | 站内反馈00 | |
| Claude Scientific Writer 开源仓库 · K-Dense-AI/claude-scientific-writer | 解决什么科研写作工具包，覆盖论文、基金、临床报告和视觉产物的生成 | 科研阶段 文献写作验证 | GitHub Stars 2,083 2026-07-11 | 站内反馈00 | |
| AutoFigure 开源仓库 · ResearAI/AutoFigure | 解决什么把论文方法文本或描述转成科研图代码，评审迭代后输出可编辑SVG | 科研阶段 写作 | GitHub Stars 1,735 2026-07-11 | 站内反馈00 | |
| causal-learn 开源仓库 · py-why/causal-learn | 解决什么从观测数据中自动学习变量间的因果结构图，覆盖三大流派 | 科研阶段 设计分析 | GitHub Stars 1,646 2026-07-11 | 站内反馈00 | |
| PaSa 开源仓库 · bytedance/pasa | 解决什么把复杂学术问题拆成多条搜索式，自动检索并筛选最相关论文 | 科研阶段 起步文献 | GitHub Stars 1,622 2026-07-11 | 站内反馈00 | |
| ToolUniverse 开源仓库 · mims-harvard/ToolUniverse | 解决什么把1000+科学工具统一封装成LLM可调用的标准协议，用一次对话发现并执行它们 | 科研阶段 文献设计分析 | GitHub Stars 1,561 2026-07-11 | 站内反馈00 | |
| OpenScholar 开源仓库 · AkariAsai/OpenScholar | 解决什么用检索增强生成回答科研问题，并自动插入带编号的引用文献 | 科研阶段 文献写作 | GitHub Stars 1,557 2026-07-11 | 站内反馈00 | |
| medical-research-skills Skill · aipoch/medical-research-skills | 解决什么554个医学研究专用skill，覆盖协议设计到写作合规的全生命周期 | 科研阶段 设计分析写作文献验证 | GitHub Stars 1,397 2026-07-11 | 站内反馈00 | |
| MetaScreener 开源仓库 · ChaokunHong/MetaScreener | 解决什么多LLM协作的系统综述自动化平台，从检索到偏倚评估全链路 | 科研阶段 文献验证写作 | GitHub Stars 1,319 2026-07-11 | 站内反馈00 | |
| MedRAX 开源仓库 · bowang-lab/MedRAX | 解决什么ICML 2025胸片推理agent，用LLM调度多个专用模型回答临床问题 | 科研阶段 分析验证 | GitHub Stars 1,194 2026-07-11 | 站内反馈00 | |
| infiAgent 开源仓库 · polyuiislab/infiAgent | 解决什么用YAML配置多层agent完成跨小时/跨天的全流程科研任务 | 科研阶段 起步文献设计分析写作 | GitHub Stars 1,181 2026-07-11 | 站内反馈00 | |
| CausalPy 开源仓库 · pymc-labs/CausalPy | 解决什么用贝叶斯方法做准实验因果推断，含10+方法和稳健性诊断套件 | 科研阶段 设计分析验证 | GitHub Stars 1,162 2026-07-11 | 站内反馈00 | |
| AgentSociety 开源仓库 · tsinghua-fib-lab/AgentSociety | 解决什么用LLM驱动的大规模社会模拟平台，支撑计算社会科学全流程研究 | 科研阶段 文献设计分析写作 | GitHub Stars 1,118 2026-07-11 | 站内反馈00 | |
| linearmodels 开源仓库 · bashtage/linearmodels | 解决什么Python面板回归与工具变量估计库，处理内生性和多维面板数据 | 科研阶段 分析设计 | GitHub Stars 1,052 2026-07-11 | 站内反馈00 |
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