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Claude Scientific Writer

科研写作工具包，覆盖论文、基金、临床报告和视觉产物的生成

以Claude Code插件和Python API形式提供19个科研写作skill。适合需要从论文、基金申请到海报、幻灯片一站式生成的研究者，也覆盖临床报告和同行评审场景。

bo老师判断：值得观察

方向值得关注，建议先确认当前任务是否真正需要它。

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...

什么时候用

先判断任务是否合适

需要从研究主题和数据一键生成论文草稿
准备基金申请书并需要按NSF/NIH结构组织
想把论文转成学术海报或会议幻灯片
需要一个集成文献检索、引用管理和格式化的写作环境

先准备什么

材料越清楚，结果越有用

•准备好研究主题、数据文件和相关论文素材
•配置Anthropic API密钥用于Claude Agent调用
•如需文献检索需配置research-lookup后端

它会怎样推进

从材料到可以检查的结果

01
初始化项目
安装插件，运行初始化命令，把科研写作规范注入项目配置文件
02
输入材料
提供研究主题、数据文件、图片和已有草稿，工具按类型分到对应目录
03
检索文献
按关键词搜索文献，提取DOI和元数据，生成BibTeX并校验引用字段
04
生成草稿
按IMRAD结构生成论文，或按基金模板生成申请书的各部分内容
05
输出产物
草稿、终稿、引用、图表分别写入标准化输出目录

第一次这样开始

把仓库地址直接交给 AI

先让 AI 说明环境和风险，再完成最小安装验证。跑通以后，再把自己的真实材料放进去。

第一次直接复制

帮我安装这个库：https://github.com/K-Dense-AI/claude-scientific-writer
安装前先告诉我需要什么环境，安装后帮我跑通一个最小示例。

结果出来后

先看这些检查点

引用是否真实存在且支持正文中的主张
输出目录的drafts/final/references/figures是否完整
基金申请书的预算和团队信息是否来自真实数据
临床报告是否已确认无个人健康信息泄露

常见误区

这些判断仍由你负责

直接使用CLI模式时未注意它会删除data目录中的原始文件
把AI生成的引用当作已验证而不逐条核对其真实性
在临床场景下跳过人工复核直接把AI输出用于诊疗决策

技术依据

查看能力拆解、验证范围与来源

能力地图6 项已拆解能力

01
CLI与API调度写作产物生成
通过 Python API 或 scientific-writer CLI 收集研究主题、模型、输出目录、API key 和数据文件，把 .claude 写作上下文复制到工作目录，再调用 Claude Agent SDK 生成论文或报告产物，并扫描 writingoutputs 得到结果对象。
02
临床科研文档与决策支持
把病例、试验、队列、诊断、治疗方案和临床证据整理为临床报告、医学论文、决策支持文档或治疗计划，并用报告指南、证据分级和隐私约束约束输出。
03
基金申请与投稿格式装配
围绕资助机构、投稿场景或学术 venue 要求，把研究目标、创新点、方法、预算、影响和格式规范装配为基金申请书、投稿材料或符合 venue 模板的研究产物。
04
插件初始化与skill分发
通过 Claude Code marketplace 插件安装、初始化命令、模板 CLAUDE.md 和 skills/ 目录，把科研写作相关能力分发到用户项目，并让 Claude Code 在后续会话中按任务自动加载相应 skill。

能力	主要输入	主要输出	人工检查
CLI与API调度写作产物生成源码已核对	query outputdir apikey 或 ANTHROPICAPIKEY	writingoutputs/<timestamp<topic/ drafts/ final/	是否允许 CLI 删除原始 data 文件。是否允许以 bypass 权限运行 Claude Agent。是否接受当前 model 映射和 Stop hook 继续策略。
临床科研文档与决策支持源码已核对	病例资料、试验结果、队列数据或诊断信息。临床问题、患者群体、干预和结局。报告指南：CARE、CONSORT、STROBE、PRISMA 或 GRADE。	临床病例报告。临床试验或队列分析报告。治疗建议报告。	是否含个人健康信息。输出是否用于真实临床决策。指南和证据是否为最新版。
基金申请与投稿格式装配源码已核对	资助机构或项目类型。研究目标、背景、方法、团队和预算。 specific aims、broader impacts、timeline、deliverables。	specific aims。 project summary。 research strategy。	资助机构和申请类型是否明确。预算、团队和时间线是否真实。模板是否为当前周期最新版。
插件初始化与skill分发源码已核对	Claude Code plugin marketplace URL。 marketplace.json 中的 skill path 列表。初始化命令。	目标项目的 CLAUDE.md。被 Claude Code 可发现的 skill 描述。初始化时可能产生的备份或合并版本。	是否覆盖、备份或合并现有 CLAUDE.md。是否接受 marketplace 只分发 19 个 skill 的范围。 README 命令和 command 文件命令哪一个是当前真实入口。
文档转换与办公文件处理源码已核对	PDF、DOCX、PPTX、XLSX、CSV、JSON、XML、HTML、图片、音频、ZIP、EPUB 或网页 URL。目标输出格式。 MarkItDown、pandoc、qpdf、LibreOffice 等本地工具。	Markdown 来源文件。编辑后的 DOCX、PDF、PPTX 或 XLSX。提取的表格、图片或文字。	是否允许修改原始办公文件。是否需要保留原文件。 license 是否允许当前使用场景。
文献检索与引用治理源码已核对	研究问题和关键词。文献数据库范围。 DOI、PMID、arXiv ID、URL 或论文题名。	文献综述草稿。检索结果和 sources 文件。 BibTeX 文件。	检索范围是否覆盖目标领域。引用是否真实、可访问且支持对应句子。是否允许调用外部搜索后端。

处理机制

01
核心处理链
科研写作工具包，覆盖论文、基金、临床报告和视觉产物的生成

已核对范围

读取 Python API generatepaper 的参数、环境变量、Claude Agent SDK 调用和输出扫描
读取 CLI 主流程、交互入口、已有论文检测和 data 文件处理分支
读取 core.py 对 .claude 目录复制、输出目录和文件路由的实现
读取 clinical-reports skill 的临床报告类型和合规约束
读取 clinical-decision-support skill 的队列分析、治疗建议和证据分级流程
读取 docs/SKILLS 中 clinical 和 treatment plan 相关能力概览
读取 research-grants skill 的申请书结构、机构类型和审查维度
读取 docs/SKILLS 中 venue-templates 与科研申请相关 skill 概览

仍待核对

未运行 generatepaper
未调用 Claude Agent SDK
未验证真实 token 统计、Stop hook 或输出质量
未在 data 目录放入真实文件验证删除行为
未处理真实临床数据
未生成病例报告、临床试验报告或治疗建议
未验证 HIPAA、CARE、CONSORT、GRADE 或监管合规
未生成基金申请书

原仓库

K-Dense-AI/claude-scientific-writer

读取版本

2d323a17101fcd6458eea591867495a3aa05e908

许可

MIT

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用贝叶斯方法做准实验因果推断，含10+方法和稳健性诊断套件

查看内容

能力	主要输入	主要输出	人工检查
CLI与API调度写作产物生成源码已核对	query outputdir apikey 或 ANTHROPICAPIKEY	writingoutputs/<timestamp<topic/ drafts/ final/	是否允许 CLI 删除原始 data 文件。是否允许以 bypass 权限运行 Claude Agent。是否接受当前 model 映射和 Stop hook 继续策略。
临床科研文档与决策支持源码已核对	病例资料、试验结果、队列数据或诊断信息。临床问题、患者群体、干预和结局。报告指南：CARE、CONSORT、STROBE、PRISMA 或 GRADE。	临床病例报告。临床试验或队列分析报告。治疗建议报告。	是否含个人健康信息。输出是否用于真实临床决策。指南和证据是否为最新版。
基金申请与投稿格式装配源码已核对	资助机构或项目类型。研究目标、背景、方法、团队和预算。 specific aims、broader impacts、timeline、deliverables。	specific aims。 project summary。 research strategy。	资助机构和申请类型是否明确。预算、团队和时间线是否真实。模板是否为当前周期最新版。
插件初始化与skill分发源码已核对	Claude Code plugin marketplace URL。 marketplace.json 中的 skill path 列表。初始化命令。	目标项目的 CLAUDE.md。被 Claude Code 可发现的 skill 描述。初始化时可能产生的备份或合并版本。	是否覆盖、备份或合并现有 CLAUDE.md。是否接受 marketplace 只分发 19 个 skill 的范围。 README 命令和 command 文件命令哪一个是当前真实入口。
文档转换与办公文件处理源码已核对	PDF、DOCX、PPTX、XLSX、CSV、JSON、XML、HTML、图片、音频、ZIP、EPUB 或网页 URL。目标输出格式。 MarkItDown、pandoc、qpdf、LibreOffice 等本地工具。	Markdown 来源文件。编辑后的 DOCX、PDF、PPTX 或 XLSX。提取的表格、图片或文字。	是否允许修改原始办公文件。是否需要保留原文件。 license 是否允许当前使用场景。
文献检索与引用治理源码已核对	研究问题和关键词。文献数据库范围。 DOI、PMID、arXiv ID、URL 或论文题名。	文献综述草稿。检索结果和 sources 文件。 BibTeX 文件。	检索范围是否覆盖目标领域。引用是否真实、可访问且支持对应句子。是否允许调用外部搜索后端。

先判断任务是否合适

材料越清楚，结果越有用

从材料到可以检查的结果

初始化项目

输入材料

检索文献

生成草稿

输出产物

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先看这些检查点

这些判断仍由你负责

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已核对范围

仍待核对

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