Science-Skills

它会给你什么

• 模型预测的分数摘要。
• 参考碱基与替代碱基的对比轨道图。
• 关键序列片段的线索和结构化解释。

你需要准备

• 变异位置，通常写成 染色体:位置:参考碱基:替代碱基 的形式。
• 目标组织或细胞类型，可以用标准编号表示（如 UBERON、CL）。
• 想看哪类数据：基因表达、染色质开放性、蛋白结合或剪接。

由你把关

• 你是否接受 AlphaGenome 的使用条款。
• 接口密钥是否由你自己在本地写入。
• 目标组织、细胞类型和编号是否正确。

它会给你什么

• 已安装或可发现的技能包清单。
• 目标技能的运行前置检查结果。
• 一个隔离的运行环境。

你需要准备

• 你的科学任务需求。
• 技能包的安装入口，比如仓库说明页里的安装命令或插件入口。
• 每个技能目录里的说明文件、可选脚本和参考资料。

由你把关

• 运行环境工具是否由你安装。
• 第三方数据源的条款是否由你接受。
• 接口密钥或联系邮箱是否由你在本地写入。

它会给你什么

• 候选论文清单。
• PDF、网页或全文文本，以及 LaTeX 源码包。
• 每篇论文的编号信息（PMID、DOI、arXiv 编号等）。

你需要准备

• arXiv 的查询语句、论文编号、下载格式和分页参数。
• bioRxiv 或 medRxiv 的论文编号、分类、起止日期、关键词或作者。
• Europe PMC 的查询语句、论文编号、排序和分页设置。

由你把关

• 是否允许调用外部文献接口。
• 数据源密钥是否由你提供。
• 特定论文或数据源的条款是否由你接受。

它会给你什么

• 规范编号和候选对象。
• 临床意义、评审状态、相关疾病表型和冲突提示。
• 变异编号、坐标和多种写法。

你需要准备

• ClinVar 查询条件、变异编号、基因名或临床显著性条件。
• dbSNP 的 rs 编号、VCF 坐标、HGVS 写法或基因组版本。
• Ensembl 的基因名或编号、基因组区间、物种和版本。

由你把关

• 物种和基因组版本是否正确，由你确认。
• 是否需要完整的原始返回数据。
• NCBI、Ensembl、gnomAD、UniProt 等数据源条款是否由你接受。

它会给你什么

• 药物、靶点、疾病、试验和监管事件的候选数据。
• 药物活性、适应症、警示和已知药物信息。
• 试验的方案详情、入组条件、结果和不良反应模块。

你需要准备

• 药物名称或编号（ChEMBL、PubChem 编号、SMILES 结构式等）。
• 靶点基因及其编号（UniProt、Ensembl），或疾病编号。
• 临床试验的条件、干预措施、阶段和状态过滤。

由你把关

• 各数据源的条款是否由你接受。
• 是否允许真实调用外部接口。
• 跨库编号冲突时要不要合并，由你决定。

它会给你什么

• 结构文件和置信度的文本解释。
• RCSB PDB 的查询结果、坐标文件和实验信息。
• 结构相似的候选蛋白。

你需要准备

• UniProt 编号、PDB 编号、FASTA 文件或直接的蛋白序列。
• .cif 或 .pdb 结构文件。
• 结构搜索数据库、序列比对工具的输出路径。

由你把关

• 输入的蛋白编号或结构文件是否正确。
• 结构质量是否足以支撑后续分析。
• 是否允许调用外部结构和序列服务。